尖锐湿疣易复发原因之一为存在亚临床型，即肉眼看不见疣体，此类患者可无症状，是病毒携带者，通过性接触而感染他人，因而应引起重视。专家表示，尖锐湿疣治疗后并不是万事大吉，还应预防其复发。
5%醋酸试验阳性即可检出此型尖锐湿疣，称为醋酸白现象。其原理为蛋白质凝固的的结果，HPV感染的细胞产生的角蛋白与正常上皮细胞产生的不同，只有HPV感染细胞才能被醋酸脱色。亚临床型尖锐湿疣组织病理上有尖锐湿疣改变。
除了尖锐湿疣的亚临床感染外，还有更早期的HPV感染，称之为HPV潜伏感染。为减少尖锐湿疣的复发，需注意以下几点：1、尖锐湿疣复发的原因可能与患者存在其他性传播疾病有关，因而在治疗尖锐湿疣时应全面检查性传播疾病，若有其他性传播疾病要及时治疗。
2、尖锐湿疣复发也可能与亚临床感染存在有关，因而治疗时可应用5%醋酸检查，以进行彻底治疗。
3、HPV潜伏感染也可导致尖锐湿疣的复发。由于有HPV潜伏感染使非皮损区产生新的临床和亚临床皮损，当CO2激光或液氮冷冻等局部去疣治疗后，通过溃疡周围HPV感染细胞，使原皮损部再发新的皮损。60%尖锐湿疣患者尿道内有HPV潜伏感染，成为传播HPV的库存灶，既可造成性伴间的HPV感染，又可通过自身感染，导致尖锐湿疣复发。由于尖锐湿疣HPV潜伏感染广泛存在于生殖器的非皮损区及尿道内，因而单纯的局部疗法有时是不够的，寻找更有效的调节宿主免疫功能的方法，将是治疗尖锐湿疣的方向。
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